Il Seminario Vescovile di Vicenza, il nono Seminario istituito in Europa dopo la conclusione del Concilio di Trento che con il decreto “Cum adolescentium aetas” istituiva i Seminari quali centri delegati alla formazione ed alla cura vocazionale dei futuri sacerdoti, venne fondato nel 1566 per volontà del vescovo Matteo Priuli. All’epoca il Seminario non si trovava nella sede attuale, non ancora edificata, ma i prossimità della Chiesa Cattedrale nel pieno centro storico di Vicenza.
Tra il 1797 ed il 1801 il Seminario venne requisito dalle truppe francesi che cacciarono con violenza i seminaristi e i loro superiori. Il vescovo Giuseppe Maria Peruzzi (1818-1830) trasferì il Seminario in borgo San Felice ed acquistò Palazzo Porto in piazza Castello, attribuito ad Andrea Palladio, per collocarvi la Biblioteca del Seminario.
Sarà il vescovo Giovanni Giuseppe Cappellari (1832-1860) che, ritenendo la struttura del Seminario oltremodo insoddisfacente, a decidere di dare una sede nuova e definitiva all’Istituto presso Borgo Santa Lucia, poco fuori dalle mura cittadine. I lavori di costruzione, secondo il progetto dell’architetto Francesco Lazzari, iniziarono nel 1842 ma i moti d’indipendenza del 1848 costrinsero a sospendere i lavori che vennero conclusi soltanto nel 1854.
Quando nel 1859 scoppiò la II guerra d’Indipendenza il Seminario venne requisito e adibito prima ad ospedale militare e successivamente a quartiere delle truppe austriache che causarono danni e saccheggi. Nel 1860 divenne vescovo di Vicenza Giovanni Antonio Farina (1860-1888), oggi Santo, che continuò a richiedere la restituzione del seminario che venne restituito solo nel 1863.
Allo scoppio della Grande Guerra il Seminario venne fin dal primo giorno, il 24 maggio 1915, nuovamente requisito ed utilizzato come Ospedale Militare. A testimonianza di quest’ultimo utilizzo dell’edificio rimangono nella facciata principale di Borgo Santa Lucia delle croci rosse. Fino al 28 febbraio 1919 furono ospitati nell’edifico 142.304 feriti.
Negli anni cinquanta del Novecento, per rispondere all’esigenza di nuovi spazi venne costruito il seminario minore voluto dal vescovo Carlo Zinato (1943-1971). Ora questo edificio è utilizzato dall’ospedale cittadino e da una scuola della città.
Nel 2020 l’edificio ottocentesco è stato donato alla Diocesi ed oggi, con il nome di Centro Diocesano “Mons. Arnoldo Onisto”, ospita oltre alle Comunità residenti del Seminario, buona parte degli uffici della curia diocesana, l’Istituto Superiore di Scienze Religiose e l’istituto diocesano di musica sacra e liturgica “E. Dalla Libera”.